В одном проекте было принято решение хранить все файлы в базе данных. В статье Huge File Storage in Database instead of File System описан наилучший вариант — для хранения файлов создается две таблицы: в одной хранятся метаданные, а в другой тело файлов, разбитое на куски по 512 000 байт.